Идею самовоспроизводящихся программ изложил «отец» компьютера Джон фон Нейман. Материалы лекций на эту тему, которые он читал начиная с 1949 года, Нейман обобщил в научном труде «Теория самовоспроизводящихся автоматических устройств» более 60 лет назад - в 1951 году.
Первой эпидемией компьютерных вирусов можно считать произошедшую в 1987 году эпидемию достаточно безвредного вируса Brain, который за год своего существования поразил множество компьютеров по всему миру, хотя изначально создавался для определения уровня компьютерного пиратства в Пакистане.
Начиная с 1990 года проблема вирусов начинает принимать глобальный размах.В начале года вышел первый полиморфный вирус — Chameleon. Данную технологию быстро взяли на вооружение, в сочетании со стелс-технологией (Stealth) и бронированием (Armored). Во второй половине 1990 года появились два стелс-вируса — Frodo и Whale. Оба вируса использовали крайне сложные стелс-алгоритмы, а 9-килобайтный Whale к тому же применял несколько уровней шифровки и антиотладочных приёмов.
